Hoe pijnlijk het ook is, het bestuur mag een advies, dat het krijgt van de klachtencommissie, bij een gegronde klacht naast zich neerleggen. Ouders zijn daardoor terecht vaak erg gefrustreerd; na de hele klachtenprocedure, waarin zij in het gelijk zijn gesteld, mag het bestuur van de school het advies van de klachtencommissie naast zich neerleggen. Indertijd is namelijk bepaald door de wetgever dat het advies van de klachtencommissie niet bindend is.

Maar een bestuur dat zijn taak serieus neemt zal niet zonder duidelijke reden van een advies afwijken. Toch kan het voorkomen dat dit wel gebeurt.

Bij een openbare school valt dit besluit van het bestuur onder de Algemene Wet Bestuursrecht. Dat betekent dat het een voor bezwaar/beroep vatbare beslissing is. Direct belanghebbenden kunnen dan bezwaar aantekenen met de volgende procedure:

• binnen 6 weken na de uitspraak van het bestuur, bij het bestuur protesteren, een bezwaarschrift indienen
• voordat het bestuur een nieuwe beslissing neemt, moet aan degene die het bezwaarschrift ingediend heeft, zijn of haar mening worden gevraagd
• binnen 6 weken besluit het bestuur over het bezwaarschrift. Als het besluit negatief uitpakt, kan men binnen 6 weken, in beroep gaan bij de rechtbank (de afdeling bestuursrecht van de arrondissementsrechtbank)

Bij een bijzondere school valt dit besluit onder het private recht en kan een klager of aangeklaagde alleen zijn of haar recht halen via een gerechtelijke procedure.